Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms