Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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