Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRA1Q9HD15 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRA1Q9HD15 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRA1Q9HD15 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRA1Q9HD15 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRA1Q9HD15 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRA1Q9HD15 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms