Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms