Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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