Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms