Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPO3Q9BXY4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms