Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIRIP3Q9BW71 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms