Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTDSS2Q9BVG9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms