Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms