Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACSBG1Q96GR2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSBG1Q96GR2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms