Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-CQ95604 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms