Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms