Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms