Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP3Q6NUK4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms