Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPPQ6IPU0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms