Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms