Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms