Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL24A1Q17RW2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms