Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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