Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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