Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms