Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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