Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA1Q15788 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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