Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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