Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms