Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMCO1Q147U7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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