Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
FAM53BQ14153 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM53BQ14153 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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