Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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