Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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