Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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