Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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MKRN4PQ13434 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN4PQ13434 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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