Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms