Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRAF1Q13077 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF1Q13077 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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