Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP3Q12983 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms