Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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