Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF2Q12947 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXF2Q12947 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXF2Q12947 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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