Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMAN2Q12907 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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