Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms