Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAD51Q06609 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms