Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms