Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms