Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms