Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPNP63162 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms