Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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