Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MCCD1P59942 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms