Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms