Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPAP53621 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPAP53621 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPAP53621 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPAP53621 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPAP53621 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPAP53621 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms