Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA2P51531 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms