Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms